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在shell中使用sendmail发送邮件
cat > sendmymail.sh#!/bin/bash/usr/sbin/sendmail -t To: [email protected] Cc: [email protected] ...
linux/shell 文本文件删除/删掉空行Notepad++ v5.8.7，TextFX， 删除空行
分别用sed awk perl grep 实现： 1 sed '/^$/d' input.txt > output.txt #output file: output.txt 2
awk 传入外部参数
awk 传入外部参数num1=1.1num2=2.2result=$(awk -v n1=$num1 -v n2=$num2 'BEGIN{print (n2>n1)?1:0}'
awk输出单引号，双引号
双引号：awk '{print "\""}' #放大：awk '{print " \" "}'使用“”双引号
Linux系统下统计目录及其子目录文件个数
（1）查看某目录下文件的个数： ls -l |grep "^-"|wc -l 或 find ./company -type f | wc -l （2）查看某目录下文件的个数，包括子
shell查找匹配行，输出该行并输出下面的一行
查找匹配行，输出该行并输出下面的一行 grep： grep -A 1 'keyword' file ### has bug awk:awk '$0~/keyword/{prin
bwa的使用方法
bwa的使用需要两中输入文件： Reference genome data（fasta格式 .fa, .fasta, .fna） Short reads data (fastaq格式 .fastaq,
wget 批量下载目录文件
wget -r -p -k -np http://源目录 ./本地目标目录
shell bash判断文件或文件夹是否存在
#shell判断文件夹是否存在#如果文件夹不存在，创建文件夹if [ ! -d "/myfolder" ]; then mkdir /myfolderfi#shell判断文件,目录
linux 查看各目录文件夹下文件大小
# 显示总大小（/下全部文件占用大小）du -sh /* | sort -nr# 显示各文件夹的大小（当前文件夹下各文件夹的大小）du --max-depth=1
Linux Shell文件差集
file1-file2 => file3file1=/data/aaafile2=/data/bbbfile3=/data/cccsort -m $file3
awk实现替换字符串中指定位置之间的内容
# 显示第xx行的第yy列的一个字符sed -n 'xx,xxp' file | awk '{print substr($0,yy,1);}'# 修改第xx行的第yy列
Makefile简介
1.源程序的编译在Linux下面，如果要编译一个C语言源程序，我们要使用GNU的gcc编译器。 下面我们以一个实例来说明如何使用gcc编译器。假设我们有下面一个非常简单的源程序(hello.c)：in
shell中$0,$?,$!等的特殊用法
变量说明:$$Shell本身的PID（ProcessID）$!Shell最后运行的后台Process的PID$?最后运行的命令的结束代码（返回值）$-使用Set命令设定的Flag一览$*所有参数列表。
grep/awk/sed 或者 并且 否定
Grep 'OR' Operator grep 与“或”一起用Find all the lines in a file, that match any of the following
Shell中数学计算/运算
shell中的赋值和操作默认都是字符串处理。1)使用let(只能进行整数运算)var=1let "var+=1"echo $var输出结果为2 注意：a)let几乎支持所有的运算符
linux 中 ll 命令如何让查询结果按时间升序或降序排序？
-t选项的功能是使输出的结果将以时间降序排列。如果希望按时间的升序排列，可以使用管道符将返回的结果传入tac命令。用法示例：查询当前目录的文件并以降序排列：ll -t查询当前目录的文件并以升序排列：l
VirtualBox内Linux系统怎样与Windows共享文件夹
打开虚拟机进入Ubuntu系统，首先要安装VirtualBox增强功能包(VBoxGuestAdditions) 。 点击运行后，系统会自动安装，安装完成后要求重启系统。 在本机系统设置一个共享文件夹
change the walltime for currently running PBS job (qalter pbs)
qalter jobid -l walltime=Xe.g.qalter 377470.manager -l walltime=2222:00:00qalter: Unauthorized Reque
pbs "ll: command not found"
可以用 ls -ltr 替代 ll
shell 标出输入、标准输出、错误输出
shell中可能经常能看到：>/dev/null 2>&1 eg：sudo kill -9 `ps -elf |grep -v grep|grep $1|awk '{pri
linux bash shell 流程控制if/else
本文转自：http://blog.csdn.net/flowingflying/article/details/5069646 本文也即《Learning the bash Shell》3rd Edi
linux下gzip的压缩详解
Linux压缩保留源文件的方法： gzip -c filename > filename.gz Linux解压缩保留源文件的方法： gunzip -c filename.gz > file
shell 随机从文件中抽取若干行
shuf -n5 main.txtsort -R main.txt | head -5awk -vN=5 -vC="`wc -l file`" 'BEGIN{srand()
shell删除最后一列、删除第一行、比较文件
删除文件第一行：sed -i '1d' filename删除文件最后一列：awk '{print $NF}' filename比较文件的方法：1）comm -3 --n
awk 以HWI开头，并且：相邻两行的第一个字段完全相同；
## 思路：以HWI开头，并且：相邻两行的第一个字段完全相同；awk 'BEGIN{ last_col_1="xxxxxx"; last_row="bbbbbbb
Linux 在一个命令行上执行多个命令
1. ;被分号(;)所分隔的命令会连续的执行下去，就算是错误的命令也会继续执行后面的命令。# lld ; echo "ok" ; lok-bash: lld: command no
Linux 执行ll命令时指定按文件时间排序或文件大小排序
按时间排序： $ ll -ht 按大小排序： $ ll -hS 使用--help查看命令的用法，如 $ ll --help
Linux运行变量中的命名脚本
single="ls -l"$single=============multi="ls -l | grep e"echo $multi > tmp.shb
Shell awk 求标准差
cat > temp000180255798957892187719awk '{x[NR]=$0; s+=$0; n++} END{a=s/n; for (i in x){ss += (
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