BASH – 根据variables创build和填充目录

我正在编写一个BASH脚本，它循环遍历列表文件pt2.lst的内容，运行一个Perl脚本并使用基于pt2.lst内容的文件名保存输出。 以下代码工作：

while read p; do perl Collect_Vaf.pl $1 $p > "$p_vaf.lst" done < pt2.lst

…只是因为Perl脚本使用第二个命令行参数来命名打印到的文件。 运行上面的脚本“perl Collect_Vaf.pl $ 1 $ p”也可以在这种情况下工作。

我不想将文件保存在脚本运行的同一目录中，而是想根据pt2.lst的内容创build名称为新的目录。 我认为这将工作：

while read p; do STR = "Sample_$p" mkdir $STR perl Collect_Vaf.pl $1 $p > "$STR/$p_vaf.lst" done < pt2.lst

但是这给了我循环的每个迭代的以下三个错误消息：

如何循环通过命令的输出？

Cmultithreading处理，意外的cpu消耗

如何在Windows命令行中执行for循环？

批处理脚本“继续”在循环？

批处理循环脚本

Vaf_Plotter.sh: line 11: STR: command not found usage: mkdir [-pv] [-m mode] directory ... Vaf_Plotter.sh: line 13: /.lst: Permission denied

如何创build基于variables的目录，然后将文件保存到循环中的所有目录？

以下是可能相关或不相关的详细信息列表：

文件pt2.lst是用bash脚本生成的。 每行包含一个4-5位数字

我打算通过在循环中运行多个脚本来将多个文件保存到每个新创build的目录中; 为了简单，我只包含一个

BASH脚本使用一个必需的参数$ 1来运行，它用作许多脚本命令的input文件

通过Windows批量重命名具有不同扩展名的文件

使用批处理脚本循环延迟扩展

遍历目录中的文件，创build输出文件，linux

继续总是非法在JS中切换，但打破工作正常

Bash：循环直到命令退出状态等于0

去除赋值运算符周围的空格。 那就是，而不是这个：

STR = "Sample_$p"

你必须这样写：

STR="Sample_$p"

另一个问题在这里：

perl Collect_Vaf.pl $1 $p > "$STR/$p_vaf.lst"

应该：

perl Collect_Vaf.pl $1 $p > "$STR/${p}_vaf.lst"

因为根据你的错误信息，没有名为$p_vaf变量。 这也意味着，当你描述你的第一个例子是“它的工作”，当然这是不正确的。