c# – 在大清单中找到彼此的近点

我有一个结构节点的大列表(如300000个元素),其中Node被定义为

public struct Node
{
    public int nid;
    public double x,y,z;
}

并且我想知道哪些节点彼此接近一定量(在代码中称为间隙),以便组合在一起的元素.
请注意,对于给定的节点分布,每个节点仅属于一个集合.

我试着用这种方式,循环每个节点并使用Linq查询和三维空间中两点之间的距离的经典公式寻找它的邻居,但它确实很慢.

有什么建议吗？提前致谢.

List<Node> nList;
[...]

for (int i = 0; i < nList.Count; i++) // cycles through all nodes in list
{
    Node nodo_old = nList[i]; // current node

    List<Node> nset = nList.Where(n => (Math.Sqrt(Math.Pow((n.x - nodo_old.x),2) + Math.Pow((n.y - nodo_old.y),2) + Math.Pow((n.z - nodo_old.z),2)) <= gap)).ToList();

    [...]  // Now nset contains a list of neighbour nodes
}

解决方法

此算法删除已检查的节点以减少处理时间.我没有尝试你的问题,但我相信它会帮助你,因为我在另一个场景测试它,它的工作完美.

// to hold sets of neighbour nodes
Dictionary<int,List<Node>> relatedCollectionsDictionary = new Dictionary<int,List<Node>>();
int index = 0;

List<Node> nList;

while (nList.Any())
{
    var relatedCollection = nList.Where(n => (Math.Sqrt(Math.Pow((n.x - nList.First().x),2) + Math.Pow((n.y - nList.First().y),2) + Math.Pow((n.z - nList.First().z),2)) <= gap));

    List<Node> relatedCollectionList = relatedCollection.ToList();
    List<Node> relatedCollectionListForDictionary = relatedCollection.ToList();

    relatedCollectionsDictionary.Add(index++,relatedCollectionListForDictionary);

    while (relatedCollectionList.Any())
    {
        nList.Remove(relatedCollectionList.First());
        relatedCollectionList.RemoveAt(0);
    }
}

我们的想法是,您每次都要进行大量处理并遍历所有节点.但是使用这种情况,您不会多次遍历任何项目.