如何解决使用Python如何将4维数组21,32,1024,1024保存为tif图像生物医学
我想在tiff文件中保存一堆数组，以便显微镜软件可以在通道和z平面中将其读取为图像。因此，这是一个4维数组：（21,32,1024,1024）。但是我找不到办法。
例如，使用io.imsave(os.path.join(outpath),stack2)，此图像将保存为一堆单独的图像，但不会保存在代表21个z平面的32个通道的集合中。
您知道实现这一目标的任何方法吗？
解决方法
由于TIFF规范不处理多通道Z堆栈，因此需要将其他元数据与图像数据一起保存。有两种常见的元数据格式：OME-TIFF和ImageJ hyperstacks用于在TIFF中保存ZCYX图像以进行生物成像。 OME-TIFF得到更多软件的支持。 Tifffile可以读写两种格式：
import numpy
from tifffile import imwrite
image = numpy.zeros((21,32,1024,1024),dtype='uint16')
# write OME-TIFF
imwrite('zcyx.ome.tif',image)
# write ImageJ hyperstack
imwrite('zcyx.tif',image,imagej=True)
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