Toil 跨平台工作流管理系统

程序名称：Toil

授权协议: Apache 2.0

操作系统: 跨平台

开发语言: Python

Toil 介绍

Toil是一个可扩展的、高效的、跨平台的工作流管理系统，完全用Python编写。

主要特性：

• 安装方便，支持pip安装

• 支持常见的工作流语言(CWL)

• 完全支持draft-3 CWL规范，允许执行 CWL工作流

• 支持工作流描述语言(WDL)，允许执行 WDL工作流

• 跨平台支持：任何平台开发测试，任何平台部署；支持 Amazon Web服务器、Microsoft Azure；OpenStack私有云；支持GridEngine、Apache Mesos、Parasol 、Individual multi、core machines等高性能计算环境。

• 简单快速易上手的API

• 完整的文件和流管理：
  抽象的基本文件系统的细节，提供了一个统一的接口，不管环境的临时和持久的文件管理。支持原子文件传输和流接口，并提供用户数据的加密。

• 极佳的扩展性，极好的性能体验

• 排错性能极好，支持任意时刻回滚

• 工作流可以静态地声明，但在任何现有的工作中，可以在执行过程中动态地添加新的工作，允许任意复杂的工作流程图。

• 支持数据库和服务：
  例如，Apache Spark集群可以迅速的容易的集成在一个工作流程作为一种服务，并且可以设定开始和结束时间。

Toil 官网

https://github.com/BD2KGenomics/toil